手帳型ケースの多くには開閉ロックのためにマグネットが使用されています。
スマートフォンの中には、電子コンパスなど、地磁気のような弱い磁場を利用する物もありますが、周りの磁力を拾って補正する機能が含まれていますので、異常をきたすことはありません。
また、ICカードやSUICAなどの交通系カードでは磁気を使用していませんので問題なくご使用いただけます。
ただし、磁気ストライプのついたカードなどには影響を与える可能性があるため、手帳内にしまって使うことはおすすめできません。