以下の方法をお試し下さい。

・使用中のフロッピーディスクのファイルを閉じ、USBフロッピーディスクドライブのアクセスランプが点灯していないことを確認してから取り出します。
・取り出せない場合は無理に取り出さず、いったんフロッピーディスクをドライブの中に押し込み、もう一度フロッピーディスクイジェクトボタンを押して下さい。